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香港中文大学教授卢煜明在1997年就发现了孕妇外周血中存在游离的胎儿DNA，并发展出了一套新技术来准确分析和度量母亲血浆内的胎儿DNA。香港验血测胎儿性别便是依据这一发现所展开的查男女手段。而这些DNA学术上也被称为循环游离胎儿DNA，浓度约3-13%，被认为主要来自胎盘，并在分娩后数小时内从母体血液中清除。
Y染色体（Ychromosome）是决定生物个体性别的性染色体的一种。在人类中，Y染色体上有很强的决定男性的基因，即使在具有多对X染色体的个体中，只要存在着Y染色体，内外性器官就都是男性型的。
有研究表明，这些循环游离胎儿DNA在母体内达到峰值的时期，一般是在孕妈妊娠6周左右。也因此，到香港验血测胎儿性别的孕妈们被要求孕满6-7周以上B超单注明已确认胎龄满6-7周（6周胚芽够3mm；7周胚芽直径需够10MM）可以进行检测，其准确度可达99.5%以上。
除此外孕妈们还需自行排查一些干扰因素，如生过男孩未满一年，曾经流过男胎间隔不到半年，或有过重大器官移植手术，输血等经历的孕妈，一般情况下是不能进行检测的。其根本原因是若存在上述这些情况，极有可能会导致孕妈体内有Y染色体残留，从而影响到香港验血测胎儿性别结果的准确性。
